Um estudo de cima para baixo de linhagens de células de câncer colorretal não metastático e metastático humano isogênico

Uma equipe de pesquisadores da Michigan State University, da Indiana University, da Ohio State University e da Tulane University, conduziu um estudo proteômico de cima para baixo de linhas de células isogênicas de câncer colorretal metastático e não metastático humano.

Em seu artigo publicado na revista Avanços da Ciênciao grupo descreve como eles usaram o software analítico TopPIC e espectrometria de massa eletroforese-tandem para analisar proteínas em linhas celulares de colorretal Câncer células e o que eles descobriram ao fazê-lo.

Pesquisas anteriores mostraram que geralmente não é o desenvolvimento de tumores cancerígenos que é problemático com o câncer; ao contrário, é quando eles metastatizam que ocorrem problemas sérios. E por causa disso, pesquisadores médicos têm procurado marcadores que possam ser verificados para determinar se um determinado paciente tem não apenas um determinado tipo de câncer, mas também se há metástase.

Neste novo esforço, os pesquisadores desenvolveram e realizaram uma abordagem de cima para baixo para estudar proteínas associadas ao desenvolvimento de câncer colorretal metastático e não metastático e seu possível uso como marcadores para a doença.

O trabalho dos pesquisadores envolveu a análise de milhares de proteínas e proteoformas (um tipo específico de proteína) usando um produto de software chamado TopPIC procurando associações com câncer colorretal. Eles também conduziram estudos de espectrometria de massa com o mesmo objetivo em mente. A abordagem única usada pela equipe permitiu medir diretamente os proteofomas que ainda estavam intactos, o que permitiu o estudo de suas funções específicas.

Ao todo, a equipe analisou 23.622 proteoformas e 2.332 proteínas e, ao fazê-lo, descobriu que era capaz de identificar variantes que poderiam ser usadas para distinguir formas metastáticas de câncer colorretal. Eles também foram capazes de identificar aproximadamente 17.300 proteoformas associadas a câncer colorretal não metastático. Os pesquisadores também descobriram que ambas as linhas celulares tinham proteoformas que correspondiam a certos tipos de sinalização e enzimas.

Os pesquisadores concluem sugerindo que seu trabalho demonstrou claramente que linhas de celular de cânceres colorretais metastáticos e não metastáticos têm perfis proteoformes muito diferentes. Esses perfis, eles sugerem ainda, podem representar biomarcadores que em breve poderão ser procurados em novos tipos de testes desenvolvidos para atingi-los, como parte do teste para câncer colorretal.

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