A biologia dos sistemas COVID-19 descobre novas assinaturas genéticas no pulmão e no sangue total

Redes PPI e clusters de DEGs pulmonares. (A) Redes PPI de DEGs regulados positivamente emergiram dos conjuntos de dados pulmonares, construídos com as plataformas STRING (à esquerda) e NetworkAnalyst (à direita). (B) Redes PPI de DEGs regulados negativamente emergiram dos conjuntos de dados do pulmão, construídos com as plataformas STRING (à esquerda) e NetworkAnalyst (à direita). (C) Vizinhanças de clusters de DEGs regulados positivamente de conjuntos de dados pulmonares, onde as proteínas estão densamente conectadas e as vias correspondentes. Construído com Metascape. (D) Vizinhanças de clusters DEG regulados negativamente de conjuntos de dados pulmonares, onde as proteínas estão densamente conectadas e as vias correspondentes. Construído com Metascape. IBP, interação proteína-proteína; STRING, ferramenta de pesquisa para recuperação de genes/proteínas em interação. Crédito: OMICS: Um Jornal de Biologia Integrativa (2022). DOI: 10.1089/omi.2022.0104

Uma abordagem de biologia de sistemas para examinar os efeitos do vírus SARS-CoV-2 no pulmão e no sangue total identificou novas assinaturas genéticas do COVID-19 que podem representar potenciais alvos terapêuticos ou de diagnóstico. Este novo estudo foi publicado na OMICS: Um Jornal de Biologia Integrativa.

COVID-19 é uma doença sistêmica que afeta tecidos e órgãos, incluindo e além do pulmão. “O sangue é um bom indicador da resposta geral do hospedeiro, pois carrega o células imunes por todo o corpo”, afirmam os autores do estudo. “O estudo combinado dos dois tecidos pode desvendar a complexidade da resposta do hospedeiro ao SARS-CoV-2”.

Os autores correspondentes, Prof. Vangelis Manolopoulos e Nikolas Dovrolis, Ph.D., da Faculdade de Medicina da Universidade Democritus da Trácia, e co-autores em Alexandroupolis, Grécia, usaram transcriptômica e análises de expressos diferencialmente genes em amostras pulmonares e amostras de sangue total de pacientes com COVID-19 e indivíduos saudáveis.

Eles identificaram 35 genes diferencialmente expressos comuns entre o pulmão e o todo sangue, e mais importante, dois genes, a saber, CYP1B1 e TNFAIP6, que não foram previamente implicados com o COVID-19. Eles também descobriram quatro potenciais reguladores de miRNA.

“Mais de dois anos após a pandemia do COVID-19, a luta global contra o SARS-CoV-2 continua. Nosso conhecimento dos efeitos do COVID-19 em todo o organismo ainda é limitado. Nesse contexto, o estudo mostra o valor de uma abordagem de biologia de sistemas para desvendar a fisiopatologia do COVID-19 em vários tecidos. As assinaturas genéticas identificadas no estudo abrem novas possibilidades para a descoberta de medicamentos e diagnósticos do COVID-19. Convido novos manuscritos sobre biologia de sistemas e multi- pesquisa ômica para revisão por pares na revista”, diz Vural Özdemir, MD, Ph.D., DABCP, editor-chefe da OMICS.