Espera-se que o banco de imagens pancreáticas ajude a avançar na pesquisa sobre diabetes em todo o mundo

Resumo gráfico. Crédito: Padrões (2020). DOI: 10.1016/j.patter.2020.100120

O banco de imagens mais extenso de amostras do pâncreas de crianças que desenvolveram diabetes pouco antes da morte foi lançado no Vanderbilt University Medical Center, com o objetivo de avançar a pesquisa médica global no campo do diabetes.

A Universidade de Exeter e o Vanderbilt University Medical Center (VUMC) se uniram para disponibilizar imagens de alta resolução do tecido pancreático no Pancreatlas, o primeiro banco de dados de imagens on-line do mundo de tecido pancreático humano criado e hospedado no VUMC.

O pâncreas contém o células beta que produzem a insulina que controla o açúcar no sangue e por isso está implicado em doenças como diabetes. O banco de imagens é um recurso valioso para os pesquisadores porque o pâncreas humano não pode ser biopsiado com segurança, e o estudo das alterações celulares que causam o diabetes tipo 1 só pode ser realizado em amostras de pâncreas de indivíduos com a doença após sua morte.

O Exeter Archival Diabetes Biobank (EADB) inclui 345 imagens de tecido post-mortem obtidas pelo ex-professor da Universidade de Glasgow Alan Foulis na década de 1980. Essas imagens representam a maior coleção de amostras de pâncreas recuperadas de pacientes que morreram logo após o diagnóstico de diabetes tipo 1.

Foulis legou a coleção de tecidos para a Faculdade de Medicina da Universidade de Exeter após sua aposentadoria, e os espécimes foram então digitalizados pelo professor Peter In’t Veld da Vrije Universiteit Brussel. Os curadores da coleção, os professores da Exeter Noel Morgan, Ph.D., e Sarah Richardson, Ph.D., entraram em contato com os criadores do Pancreatlas para ver se as imagens poderiam ser adicionadas ao banco de dados online e disponibilizadas para qualquer pessoa no mundo. Os professores de Exeter facilitaram então a transferência da imagem.

“Estamos entusiasmados que este arquivo inestimável está agora acessível a investigadores em todo o mundo através da plataforma Pancreatlas”, disse Diane Saunders, Ph.D., professora assistente de pesquisa de Medicina e co-diretora científica da Pancreatlas.

“Este não é apenas um grupo único de amostras, mas o Exeter Archival Diabetes Biobank permitiu avanços fundamentais na pesquisa pancreática humana, incluindo o perfil de insulite e evidência de envolvimento viral na condução da autoimunidade de células beta no nível das ilhotas. expectativa de que essas imagens continuem a estimular descobertas científicas enquanto os investigadores trabalham para desmistificar o desenvolvimento do diabetes tipo 1.”

As 345 imagens da EADB representam 189 doadores diferentes, com idades entre três meses e 17 anos. O início do diabetes tipo 1 varia de poucos dias após a morte até 19 anos de duração. As imagens são de cortes de tecidos corados por hematoxilina e eosina (H&E) ou por imuno-histoquímica direcionando biomarcadores de proteínas para hormônios e outras proteínas sinalizadoras.

“Felizmente, a maioria das pessoas não morre até muito tempo após o diagnóstico de diabetes tipo 1, mas isso significa que a disponibilidade de órgãos nos quais o processo da doença ainda está ativo é muito raro”, disse Morgan, professor de Farmacologia Endócrina da Universidade. de Exeter.

“Como resultado, muito poucas pessoas em todo o mundo que estudam diabetes tipo 1 foram capazes de estudar tecidos de crianças com diabetes tipo 1 de início recente.

“O fornecimento desses registros EADB exclusivos via Pancreatlas é um grande desenvolvimento porque fornece acesso fácil a um público global e define essa coleção no contexto de outras coleções de imagens de pâncreas extremamente importantes disponíveis no site. Os critérios de pesquisa e sistemas de anotação desenvolvidos por a equipe Vanderbilt permite aos pesquisadores selecionar as imagens mais relevantes para seus próprios estudos e visualizá-las em alta resolução em suas próprias mesas.”

No total, o Pancreatlas hospeda atualmente 2.180 imagens, representando diversos biobancos e iniciativas de pesquisa. O site fornece à comunidade científica acesso a imagens anotadas de tecido pancreático humano e características de doadores associados com a esperança de avançar na compreensão de doenças como diabetes, câncer pancreático e pancreatite.

O banco de dados on-line de imagens foi projetado com base nos princípios de automação e escalabilidade, bem como na facilidade de uso. As imagens são agrupadas em coleções selecionadas para facilitar a exploração de tópicos específicos ou estados de doença ou, alternativamente, os usuários podem pesquisar imagens de interesse em todas as coleções. Os menus de filtragem permitem que os usuários visualizem e refinem imagens com base em informações experimentais (por exemplo, processamento de tecidos, biomarcadores visualizados), bem como detalhes clínicos (por exemplo, status e duração da doença).

Conjuntos de dados de imagens abrangentes de toda a vida humana também estão incluídos no Pancreatlas para fornecer contexto para pesquisadores que trabalham, por exemplo, para entender como o desenvolvimento do pâncreas pode se relacionar com diabetes progressão ou as origens do câncer de pâncreas.

A pesquisa foi publicada em Padrões.