Ferramenta multiômica aprimorada ilumina a progressão do câncer

Uma nova ferramenta desenvolvida pela Weill Cornell Medicine e pelos investigadores da Universidade de Adelaide melhorou a capacidade de rastrear múltiplas mutações genéticas e, ao mesmo tempo, registrar a atividade genética em células cancerígenas individuais. A tecnologia, que agora pode utilizar diversos tipos de amostras patológicas e processar rapidamente um grande número de células, permitiu aos investigadores obter novos conhecimentos sobre como os cancros evoluem para uma maior agressividade e resistência à terapia.

Descrito em artigo publicado em Genômica Celulara nova ferramenta, GoT-Multi, é um avanço de próxima geração em relação a uma ferramenta anterior chamada GoT (Genotyping of Transcriptomes). GoT foi altamente inovador, mas limitado na detecção de certas mutações genéticas, bem como no número de mutações que poderia detectar de uma só vez, e estava restrito a amostras de tecido fresco ou congelado.

O GoT-Multi supera substancialmente essas limitações e pode lidar com amostras de tecidos preservadas com uma substância química chamada formalina e incorporadas em cera – um tipo de amostra que compreende um vasto recurso científico em laboratórios de patologia hospitalar em todo o mundo. Os pesquisadores destacaram o potencial do GoT-Multi ao usá-lo para revelar novos detalhes de como uma leucemia relativamente indolente pode evoluir para um linfoma agressivo.

“Essa tecnologia nos dá um poder novo e substancial para responder a questões importantes sobre como o câncer evolui, desde o início do crescimento neoplásico pré-canceroso até a transformação em malignidade e, finalmente, até a resistência à terapia”, disse a coautora sênior do estudo, Dra. Anna Nam, professora assistente de patologia e medicina laboratorial, da Família Gellert/John P. Leonard, MD Research Scholar em Hematologia e Oncologia Médica, e membro do Englander Institute for Medicina de Precisão e Sandra e Edward Meyer Cancer Center da Weill Cornell Medicine.

O outro co-autor sênior do estudo foi o Dr. Luciano Martelotto, professor associado e líder da equipe do Centro de Epigenética de Adelaide, Universidade de Adelaide. Os bolsistas de pós-doutorado Dr. Minwoo Pak e Dr. Mirca Saurty-Seerunghen do laboratório do Dr.

Nam, que também é patologista do New York-Presbyterian/Weill Cornell Medical Center, liderou o desenvolvimento da ferramenta GoT no final de 2010 como pesquisador de pós-doutorado no laboratório do Dr. Dan Landau, professor de medicina da família Bibliowicz e membro do Englander Institute for Precision Medicine e do Sandra and Edward Meyer Cancer Center na Weill Cornell Medicine, e membro do corpo docente do New York Genome Center.

GoT e GoT-Multi são considerados ferramentas “multiômicas de célula única” porque permitem aos pesquisadores registrar múltiplas camadas de informações de células individuais.

Numa demonstração impressionante das capacidades únicas do GoT-Multi, os investigadores aplicaram-no a amostras de tecidos, incluindo o tipo de amostra que não conseguiram analisar, de pacientes com leucemia linfocítica crónica em transição para o linfoma mais maligno de grandes células B – uma alteração conhecida como Transformação de Richter.

A ferramenta permitiu aos investigadores traçar o perfil de dezenas de milhares de células tumorais individuais, rastrear a presença de mais de duas dúzias de mutações genéticas diferentes e ver como estas mutações se relacionavam com as atividades das células – algumas células crescendo mais rapidamente, outras alimentando a inflamação – à medida que o cancro evoluía. No geral, o GoT-Multi iluminou esta progressão maligna como nunca antes.

Os investigadores estão agora a aplicar o GoT-Multi a um grande grupo de linfomas resistentes à terapia, bem como a utilizá-lo para mapear o desenvolvimento de outros cancros e estados pré-cancerosos. Eles esperam que os insights fornecidos pelo GoT-Multi sugiram novas estratégias terapêuticas.