Nova ferramenta de triagem genômica permite a engenharia reversa de precisão da programação genética em células

A pesquisa colaborativa liderada por pesquisadores no centro de câncer e transtornos sanguíneos de Dana-Farber/Boston define uma abordagem nova para entender como certas proteínas chamadas fatores de transcrição determinam quais programas genéticos impulsionarão o crescimento e maturação celular. O estudo é publicado na revista Ciência.

O método, chamado “Multioma de perturbação”, usa o CRISPR para eliminar a função de fatores de transcrição individuais em muitas células sanguíneas ao mesmo tempo. Os pesquisadores realizam análises de célula única em cada célula para medir os efeitos da edição, incluindo a identificação de quais genes foram ativados ou desligados e quais genes são acessíveis (com base em marcadores epigenéticos). A equipe aplicou essa ferramenta às células sanguíneas imaturas para identificar os importantes fatores de transcrição – e as regiões de DNA que codificam para elas – que afetam fortemente a forma como as células sanguíneas se desenvolvem.

Eles descobriram que muitas das regiões de DNA identificaram como importantes para a produção de células sanguíneas também são regiões conhecidas por abrigar mutações ligadas a distúrbios sanguíneos. As regiões de DNA que identificaram como importantes ocupam menos de 0,3% do genoma, mas explicam uma parcela desproporcionalmente grande da influência genética nas características e especialização das células sanguíneas.

Em trabalhos anteriores, os pesquisadores dessa equipe e de outros colaboradores usaram estudos de associação em todo o genoma para identificar o fator de transcrição responsável por desligar a hemoglobina fetal após o nascimento, estabelecendo as bases para o desenvolvimento da terapia gênica para doenças falciformes das células e beta-talassemia.

Essa nova abordagem do Multioma de perturbação permite que os pesquisadores revelem sistematicamente como milhares de variantes de fatores de transcrição influenciam a produção de células sanguíneas e o risco de doenças, criando oportunidades para encontrar muito mais terapias direcionadas para distúrbios sanguíneos.